Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms