Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms