Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO3A1Q9UIG8 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms