Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms