Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms