Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms