Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms