Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ86

TRIM36, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM36, humanhuman

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM36Q9NQ86 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM36Q9NQ86 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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