Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms