Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms