Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms