Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F0

ASXL3, Putative Polycomb group protein ASXL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASXL3Q9C0F0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ASXL3Q9C0F0 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms