Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS1

KRTAP1-5, Keratin-associated protein 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-5Q9BYS1 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP1-5Q9BYS1 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP1-5Q9BYS1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP1-5Q9BYS1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
KRTAP1-5Q9BYS1 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-5Q9BYS1 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms