Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms