Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms