Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWV2

SPATA9, Spermatogenesis-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA9Q9BWV2 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPATA9Q9BWV2 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms