Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NUP58Q9BVL2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NUP58Q9BVL2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NUP58Q9BVL2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NUP58Q9BVL2 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
NUP58Q9BVL2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NUP58Q9BVL2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NUP58Q9BVL2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NUP58Q9BVL2 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NUP58Q9BVL2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NUP58Q9BVL2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NUP58Q9BVL2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NUP58Q9BVL2 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NUP58Q9BVL2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NUP58Q9BVL2 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NUP58Q9BVL2 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
NUP58Q9BVL2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NUP58Q9BVL2 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NUP58Q9BVL2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NUP58Q9BVL2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NUP58Q9BVL2 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NUP58Q9BVL2 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NUP58Q9BVL2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NUP58Q9BVL2 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NUP58Q9BVL2 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NUP58Q9BVL2 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NUP58Q9BVL2 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NUP58Q9BVL2 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NUP58Q9BVL2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NUP58Q9BVL2 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
NUP58Q9BVL2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
NUP58Q9BVL2 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms