Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PI4K2AQ9BTU6 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms