Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGMNQ99538 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms