Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms