Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW4

PRIMPOL, DNA-directed primase/polymerase protein, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIMPOLQ96LW4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRIMPOLQ96LW4 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms