Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHFRQ96EP1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms