Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms