Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.261e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.261e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.261e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 NELFCD-208ENST00000482747 1701 ntTSL 216.61■□□□□ 0.256e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.251e-9■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 CTSB-226ENST00000532656 573 ntTSL 416.56■□□□□ 0.241e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.241e-9■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.221e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.221e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.222e-12■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.221e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.221e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.211e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.211e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.21e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.21e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 IL17RC-208ENST00000434756 946 ntTSL 516.29■□□□□ 0.21e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 HEXDC-204ENST00000578130 853 ntTSL 216.28■□□□□ 0.21e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 GIGYF1-203ENST00000471340 478 ntTSL 516.28■□□□□ 0.21e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.181e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.171e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 DRG2-206ENST00000496428 795 ntTSL 316.08■□□□□ 0.161e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.161e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.161e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.154e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 ERBB2-222ENST00000584908 1316 ntTSL 1 (best)15.94■□□□□ 0.141e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 NTHL1-204ENST00000562120 501 ntTSL 215.92■□□□□ 0.141e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 NTHL1-209ENST00000568513 837 ntTSL 315.92■□□□□ 0.141e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.141e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 IL17RC-224ENST00000481032 564 ntTSL 1 (best)15.91■□□□□ 0.141e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 MTMR12-207ENST00000513622 561 ntTSL 415.91■□□□□ 0.141e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.141e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.131e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.131e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 ENO2-210ENST00000539713 543 ntTSL 415.83■□□□□ 0.121e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.121e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.121e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 CTSB-210ENST00000526195 560 ntTSL 415.75■□□□□ 0.111e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 IL17RC-207ENST00000424206 949 ntTSL 315.75■□□□□ 0.111e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 NDE1-205ENST00000572756 915 ntTSL 515.75■□□□□ 0.111e-9■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.111e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 NELFCD-211ENST00000492016 606 ntTSL 215.72■□□□□ 0.116e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 CTSB-213ENST00000527215 545 ntTSL 415.69■□□□□ 0.11e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 DRG2-209ENST00000577771 641 ntTSL 215.69■□□□□ 0.11e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 PTPRA-206ENST00000430705 733 ntTSL 515.68■□□□□ 0.11e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 TTLL3-218ENST00000443148 2031 ntTSL 215.67■□□□□ 0.11e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.091e-9■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.095e-7■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.094e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 IGF2BP1-205ENST00000510023 754 ntTSL 315.57■□□□□ 0.081e-9■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 SLC25A13-203ENST00000472162 568 ntTSL 415.54■□□□□ 0.081e-9■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 PPIG-203ENST00000414307 1062 ntTSL 1 (best)15.48■□□□□ 0.071e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 NDRG1-203ENST00000517331 584 ntTSL 515.46■□□□□ 0.071e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.061e-9■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.064e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.061e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.051e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 MED15-212ENST00000436496 393 ntTSL 315.38■□□□□ 0.051e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.051e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.051e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.041e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.042e-12■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.041e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.041e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 POLG-203ENST00000526314 700 ntTSL 315.27■□□□□ 0.041e-9■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.031e-9■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 ENO2-207ENST00000537688 547 ntTSL 515.23■□□□□ 0.031e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.021e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 CTSB-215ENST00000528965 556 ntTSL 315.16■□□□□ 0.021e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.021e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 ACAP3-211ENST00000479108 485 ntTSL 315.12■□□□□ 0.011e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 DRG2-203ENST00000467099 2531 ntTSL 215.1■□□□□ 0.011e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.012e-12■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 NDRG1-223ENST00000522665 411 ntTSL 215.08■□□□□ 01e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 01e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 01e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.011e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 TMEM123-204ENST00000526676 467 ntTSL 414.96□□□□□ -0.011e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.021e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 ASPSCR1-218ENST00000583744 539 ntTSL 414.91□□□□□ -0.021e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.032e-12■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.031e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.041e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 CTSB-208ENST00000525076 550 ntTSL 514.72□□□□□ -0.051e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 ZNF687-205ENST00000443959 893 ntTSL 1 (best)14.68□□□□□ -0.061e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.061e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 MLLT6-207ENST00000618652 624 ntTSL 314.64□□□□□ -0.071e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 UBXN4-203ENST00000416538 1255 ntTSL 514.6□□□□□ -0.071e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.081e-9■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.081e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.091e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.091e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.091e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 ASPSCR1-206ENST00000578361 590 ntTSL 214.49□□□□□ -0.091e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 MTM1-204ENST00000424519 361 ntTSL 314.49□□□□□ -0.091e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 POLG-204ENST00000526398 512 ntTSL 314.48□□□□□ -0.091e-9■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 GLRX5-203ENST00000557731 1863 ntTSL 514.42□□□□□ -0.11e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 CTSB-230ENST00000534149 524 ntTSL 414.41□□□□□ -0.11e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 SFXN2-202ENST00000459894 2324 ntTSL 214.38□□□□□ -0.111e-9■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.131e-6■■■■■ 31.4
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