Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms