Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FSIP1Q8NA03 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms