Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms