Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms