Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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RNF182Q8N6D2 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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RNF182Q8N6D2 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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