Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms