Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms