Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms