Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms