Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms