Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms