Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC9A4Q6AI14 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms