Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms