Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B7

TMEM236, Transmembrane protein 236, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM236Q5W0B7 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM236Q5W0B7 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM236Q5W0B7 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM236Q5W0B7 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM236Q5W0B7 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM236Q5W0B7 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM236Q5W0B7 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM236Q5W0B7 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM236Q5W0B7 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 254.4 ms