Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms