Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
STRIP1Q5VSL9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
STRIP1Q5VSL9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
STRIP1Q5VSL9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
STRIP1Q5VSL9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
STRIP1Q5VSL9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
STRIP1Q5VSL9 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
STRIP1Q5VSL9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
STRIP1Q5VSL9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
STRIP1Q5VSL9 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
STRIP1Q5VSL9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
STRIP1Q5VSL9 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
STRIP1Q5VSL9 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms