Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms