Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms