Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms