Protein–RNA interactions for Protein: Q4VNC1

ATP13A4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A4Q4VNC1 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms