Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms