Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms