Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
FHOD3Q2V2M9 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FHOD3Q2V2M9 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FHOD3Q2V2M9 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FHOD3Q2V2M9 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FHOD3Q2V2M9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FHOD3Q2V2M9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FHOD3Q2V2M9 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FHOD3Q2V2M9 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FHOD3Q2V2M9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FHOD3Q2V2M9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FHOD3Q2V2M9 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FHOD3Q2V2M9 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FHOD3Q2V2M9 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
FHOD3Q2V2M9 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FHOD3Q2V2M9 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms