Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
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