Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
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