Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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